Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms