Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
MTMR3Q13615 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms