| MTMR3 | Q13615 | ARHGAP42P3-201 | ENST00000443989 | 2508 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | DCUN1D1-208 | ENST00000632685 | 3147 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ORC4-202 | ENST00000392857 | 6530 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | STON1-GTF2A1L-204 | ENST00000405008 | 3821 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZSCAN26-204 | ENST00000614088 | 2321 nt | TSL 3 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ATP7A-202 | ENST00000343533 | 8289 nt | TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | VPS13C-201 | ENST00000249837 | 13300 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | ZNF780B-207 | ENST00000617676 | 8664 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ABCA12-201 | ENST00000272895 | 9100 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MAP3K19-203 | ENST00000375845 | 4369 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | RNU4-42P-201 | ENST00000364738 | 142 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | MIR625-201 | ENST00000385047 | 85 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | Y_RNA.623-201 | ENST00000411128 | 95 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | NHS-AS1-201 | ENST00000452788 | 366 nt | TSL 3 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AC007390.2-201 | ENST00000606229 | 3803 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | WDR49-207 | ENST00000479765 | 2108 nt | TSL 2 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ATF7IP2-202 | ENST00000356427 | 3463 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SOCS5-201 | ENST00000306503 | 4771 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ORC4-216 | ENST00000540442 | 6472 nt | TSL 2 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CTSS-201 | ENST00000368985 | 4107 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | Y_RNA.106-201 | ENST00000363189 | 100 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | RPS17P8-201 | ENST00000434525 | 335 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AL445465.2-201 | ENST00000455530 | 461 nt | TSL 2 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AC023043.4-201 | ENST00000612081 | 449 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | ERGIC2-201 | ENST00000360150 | 5014 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SLC26A7-209 | ENST00000617078 | 5094 nt | TSL 5 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | TLK1P1-201 | ENST00000456760 | 2440 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | OR56B2P-202 | ENST00000641377 | 2453 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZNF404-202 | ENST00000587539 | 1851 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZNF299P-201 | ENST00000406845 | 1804 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | FO393401.1-201 | ENST00000453914 | 600 nt | TSL 3 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | RPL23AP65-201 | ENST00000475608 | 468 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RN7SL283P-201 | ENST00000489055 | 303 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC105758.1-201 | ENST00000506038 | 399 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-911P-201 | ENST00000516523 | 104 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | Y_RNA.687-201 | ENST00000516558 | 91 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-709P-201 | ENST00000517257 | 104 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC021713.1-201 | ENST00000526554 | 510 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC069029.1-201 | ENST00000558736 | 263 nt | TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC092138.1-201 | ENST00000568659 | 472 nt | TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC091979.2-201 | ENST00000607514 | 214 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC020634.1-201 | ENST00000608701 | 549 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC008785.1-201 | ENST00000624475 | 456 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | PTPN13-202 | ENST00000411767 | 8119 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | R3HCC1L-201 | ENST00000298999 | 3379 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | DDX20-202 | ENST00000475700 | 4332 nt | TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SLC9B1-202 | ENST00000394789 | 1735 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | DAZ1-205 | ENST00000540248 | 3268 nt | TSL 5 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CD80-201 | ENST00000264246 | 2725 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |