Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MSLNQ13421 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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