Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRIM28Q13263 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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