Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms