Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
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ERCC8Q13216 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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