Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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PGGT1BP53609 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP53609 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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