Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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