Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SH3BP1Q9Y3L3 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms