Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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