Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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HOXC10Q9NYD6 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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HOXC10Q9NYD6 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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HOXC10Q9NYD6 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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HOXC10Q9NYD6 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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HOXC10Q9NYD6 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXC10Q9NYD6 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
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