Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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LHX9Q9NQ69 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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LHX9Q9NQ69 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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LHX9Q9NQ69 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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LHX9Q9NQ69 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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LHX9Q9NQ69 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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