Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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