Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms