Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms