Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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PTPRKQ15262 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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PTPRKQ15262 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPRKQ15262 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPRKQ15262 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPRKQ15262 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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PTPRKQ15262 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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