Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BRD3Q15059 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms