Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NCAPHQ15003 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms