Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NBR1Q14596 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NBR1Q14596 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
NBR1Q14596 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
NBR1Q14596 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
NBR1Q14596 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
NBR1Q14596 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
NBR1Q14596 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NBR1Q14596 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms