Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCARB2Q14108 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms