Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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CKAP5Q14008 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CKAP5Q14008 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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