Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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NAE1Q13564 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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NAE1Q13564 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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