Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NEUROD1Q13562 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NEUROD1Q13562 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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