Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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