Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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