Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
MKRN4PQ13434 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN4PQ13434 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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