Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SNTA1Q13424 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNTA1Q13424 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNTA1Q13424 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNTA1Q13424 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNTA1Q13424 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNTA1Q13424 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNTA1Q13424 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNTA1Q13424 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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