Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SRSF6Q13247 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms