Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms