Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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ERCC8Q13216 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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ERCC8Q13216 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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ERCC8Q13216 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ERCC8Q13216 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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