Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPA4Q13156 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms