Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MKRN3Q13064 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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