Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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