Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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CHD3Q12873 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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CHD3Q12873 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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CHD3Q12873 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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CHD3Q12873 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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CHD3Q12873 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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CHD3Q12873 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD3Q12873 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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