Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN12Q05209 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN12Q05209 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN12Q05209 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN12Q05209 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN12Q05209 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN12Q05209 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN12Q05209 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN12Q05209 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN12Q05209 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN12Q05209 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms