Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRBP23467 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms