Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTPRAP18433 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTPRAP18433 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRAP18433 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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