Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SH3BP4Q9P0V3 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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