Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CIPCQ9C0C6 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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