Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms