Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED3Q96IU2 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms