Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BHMTQ93088 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BHMTQ93088 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms