Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CTXN3Q4LDR2 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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