Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RTL8BQ17RB0 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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