Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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ME3Q16798 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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ME3Q16798 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ME3Q16798 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ME3Q16798 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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