Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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SGCBQ16585 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SGCBQ16585 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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