Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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