Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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E2F4Q16254 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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E2F4Q16254 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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E2F4Q16254 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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