Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USF2Q15853 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USF2Q15853 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USF2Q15853 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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