Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ALX1Q15699 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ALX1Q15699 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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